Para alcançar seus objetivos, o subprojeto Políticas e monitoramento do bioma Cerrado foi estruturado em 4 componentes, a saber:

Componente 1 - Aumento da Conservação da Biodiversidade no Cerrado
Visa promover a conservação da biodiversidade do Cerrado por meio da criação, expansão e fortalecimento de Unidades de Conservação, o detalhamento do Plano Nacional de Áreas Protegidas para o Bioma e a elaboração e desenvolvimento de planos de manejos para espécies ameaçadas de extinção ou de potencial econômico.

Componente 2 – Uso Sustentável da Biodiversidade dentro da Paisagem Produtiva
Visa sistematizar e difundir conhecimentos tradicionais e boas práticas de manejo dos recursos naturais do bioma, estimular o uso de práticas de uso sustentável entre as propriedades apoiadas pelo projeto, além de agregar valor e favorecer a comercialização de produtos provenientes da  biodiversidade local.

Componente 3 - Desenvolvimento de Políticas
Prevê um mínimo de três novas políticas voltadas para a conservação e o uso sustentável do Cerrado, o fortalecimento institucional incluindo redes da sociedade civil e a implantação de mecanismos de controle mais eficientes sobre o desmatamento em propriedades rurais.

Componente 4 – Gestão do Projeto e Monitoração do Bioma
Este componente visa à coordenação do projeto e ao monitoramento do Bioma, tendo com objetivo o desenvolvimento de um sistema de monitoração da cobertura vegetal e uso da terra. Prevê também a criação de um banco de dados público contendo informações sobre aspectos ambientais e socioambientais.